肝细胞、肝纤维膜和胆管都可发生癌变。相对原发肝癌，其他部位的癌症(如结肠癌，肺癌、乳腺癌等)转移至肝脏的发生比例更高。
绝大多数肝癌起始于肝细胞中，这也是通常意义的肝癌；
肝纤维膜部位的癌症发生较少，较常见于年轻人中，且与肝炎病毒感染无关；
肝脏还承担分泌胆汁的作用，胆汁流动的胆管也会发生癌变。分布于肝脏内部和外部的胆管都有发生癌症的可能，分布于肝脏内的胆管发生的癌变，为肝内胆管癌；肝脏以外的胆管发生的癌症，被称为肝外胆管癌。
肝癌的高风险及发病原因
从全球范围看，中国是肝癌的发病率最高的国家。寻找有效的肝癌治疗方法，对于中国具有特别的意义。
1.引起肝癌发生的因素众多，其中60%的肝癌病例是由乙型和丙型肝炎病毒感染引起的，这其中又以乙型肝炎病毒感染居首。
2.长期过度饮酒是导致肝癌高风险的重要因素，其引起的肝硬化是导致肝细胞DNA突变，最终发生癌变的重要原因。
3.不良的生活方式如吸烟、肥胖等都被发现与肝癌的发生有关联。
4.黄曲霉菌(Aflatoxin)被发现具针对肝细胞的致癌性。黄曲霉菌由曲霉属真菌产生，存在于潮热环境久存的坚果、谷物、大豆及玉米等作物中。食用含有黄曲霉菌的食物是引发肝癌发生的原因。
5.通常来讲，肝癌在儿童和青少年中比较罕见，但肝母细胞瘤会在这类人群中发生。
用于肝癌治疗的靶向药物
Sorafenib (Nexavar)：酪氨酸激酶抑制剂 (TKI)
肝癌研究常用细胞系及其优化实验方案
| 细胞系名称 | 组织来源/细胞类型 | 细胞系特性 |
| Hep 3B2.1-7 | 人，肝细胞瘤 | 该细胞系具有致瘤性 基因组未见乙肝病毒整合 |
| Hep G2 | 人，肝细胞瘤 | Insulin receptor and IGF II receptor expressed 该细胞系不致瘤 表达乙肝病毒表面抗原 (HBsAg)，细胞基因组有乙肝病毒整合 |
| Hepa 1-6 | 从C57BL6小鼠获取的BW7756 小鼠肝细胞瘤 | 细胞系不含小鼠痘病毒 |
| C3A (HepG2/C3A) | 人肝细胞癌，为上皮细胞，是理想的转染宿主。 | 该细胞系表达大量蛋白产物，包括：alpha-fetoprotein; albumin; transferrin; alpha1 antitrypsin; beta lipoprotein等； 在免疫缺陷小鼠上不具致瘤性； 该细胞系生长至高融合度后，会出现AFP表达显著下调和白蛋白表达激增的现象； |
| Fao | 大鼠肝细胞癌，是由H4-11-E-C3的衍生细胞系。 | 该细胞系是用于研究肝单加氧酶活性及外源性化学物质（如药物、农药、致癌物等）对肝部酶活调控作用的理想工具细胞系。 |
| H-4-II-E | 大鼠肝细胞癌，为上皮细胞，常用于检测环境样品或食品提取物样品中多氯连苯（PCB,一种有机环境污染物)的含量，灵敏度可至皮克。 | 该细胞可诱导表达芳烃羟化酶； 该细胞系在建立的过程中，经历过清除支原体的操作； |
| Hepa 1-6 | C57/L小鼠干细胞癌，为上皮细胞，是理想的转染宿主。该细胞经检测不含鼠痘病毒。 | 该细胞系表达大量蛋白产物，包括：albumin, alpha fetoprotein (AFP, alpha-fetoprotein); albumin; alpha 1 antitrypsin (alpha-1-antitrypsin); amylase |
| PLC/PRF/5 | 人肝部Alexander细胞癌变的肝癌。 | 该细胞系表达 乙型肝炎表面抗原 (HBsAg)； 该细胞系建立过程中经历过使用BM-cycline 清除支原体的操作； |
| SK-HEP-1 | 该细胞系获得于人肝癌病人的腹水，为上皮细胞。该细胞系是理想的转染宿主。 | 该细胞系具有致瘤性，在裸鼠上能形成大细胞肝癌。 |
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